二二八和白色恐怖受難時間確實業已久遠，但是仍有許多倖存的受難者、家屬、後代，仍然受到創傷的侵擾。許多年邁的受難長輩夜裡仍惡夢頻頻，努力維持著正常生活的家屬和後代，其實經常背負著不為人知的苦痛。後代承受的「代間創傷」（trans-generational trauma）會以不同形式展現，有些不易察覺，有些化成身體上的不適，有些則可能以心理或精神症狀的方式出現。這些威權時期黨國體制壓迫造成的暴力創傷，需要由國家負起照護和療癒的責任。
 

立法者深知轉型正義涉及多項任務，為了避免轉型正義重要工作事項有遭到疏漏的情形，促轉條例第二條所規定規劃、推動之事項中特別羅列了「其他轉型正義事項」。創傷療癒乃世界各地轉型正義工程中重要事項之一，受到聯合國人權組織的高度重視。在過去，二二八及白色恐怖受難家庭，長年承受心理創痛而無人聞問，促轉會有責任盡速提供專業協助。促轉會成立至今，已收到許多受難家屬提出政治暴力創傷療癒需求。
 

不當黨產處理委員會依據黨產條例第1條及第2條揭示，為了建立政黨公平競爭環境，健全民主政治，以落實轉型正義，不當黨產委員會依法進行政黨、附隨組織及其受託管理人不當取得財產的調查、返還、追徵、權利回復以及黨產條例所定之其他事項等工作。而促轉會依照「促進轉型正義條例」第7條規定，主要處理不當黨產回收後的運用規劃。簡言之，不當黨產委員會主要處理不當黨產的研究和追徵、促轉會則是處理收回黨產的運用規劃。促轉會正規畫專業諮詢會議，邀請專家學者集思廣益，以合理、合憲的原則運用規劃收回之不當黨產。

轉型正義工作，是在還原歷史真相的基礎上，使社會各群體對威權統治的過往有深入完整的認識，同時其各自殊異的歷史經驗，也能在開放、接納的氛圍中充分對話，並獲得理解，構築共同的未來。本會重建社會信任工作除以檔案資料為基礎，積極還原歷史真相，也持續推動轉型正義之社會溝通，提升社會對威權統治歷史及受難者經驗的理解。

本會截至109年8月31日止，共受理79件人民聲請案，目前結案數目為40案件(撤銷有罪判決11件；駁回或不符合促轉條例第6條第3項第2款之要件29件)，尚未審查完竣者39件。促轉會將依規定進行相關之調查，屆時會將案件決議結果通知案件聲請人與進行相關公告作業。

為平復這類在威權時期為濫用刑罰權而違反自由民主憲政秩序、侵害公平審判原則的有罪判決，立法者藉由促轉條例第6條第3項規定予以撤銷。本會的工作之一便是依這項規定，公告由立法者撤銷的刑事有罪判決，從去年10月4日至今，已公布5波名單、共5861人獲得刑事有罪判決撤銷公告。
這些司法不法有罪判決又分為兩種，第一種是過去曾經依二二八事件處理及賠償條例、戒嚴時期不當叛亂暨匪諜審判案件補償條例與戒嚴時期人民受損權利回復條例獲得賠償、補償或回復受損權利的受難者。第二種則是前述情形以外之案件。於第一種情形，促轉會在核對確認受難者確曾依上述法律獲得賠償、補償或回復受損權利後，即公告其判決依促轉條例第6條第3項視為撤銷。第二種情形，由促轉會依當事人聲請或主動依職權重新調查，以釐清其案件之追訴或審判是否有違反自由民主憲政秩序、侵害公平審判原則之情形，結果若屬肯定，促轉會也會公告其判決依促轉條例第6條第3項視為撤銷。
公告撤銷有罪判決的行動在轉型正義工程中有著十分重要的意義，一是以國家之名除去受難者及其家庭長期背負的犯罪者標籤，也代表國家對於威權統治時期各種不當侵害人民的行為的反省；二是藉由這樣除去犯罪汙名的行動，象徵社會整體與受難者修復關係的決心，從而讓受難者及其家屬重塑人際網絡以及接納自己；最後透過撤銷判決重寫政治社群的集體記憶，作為社會溝通的一環。
促轉會的重要使命，是讓歷史的噤聲中，對國家暴力的反省，進入政治社群的集體記憶，並深化大眾對於轉型正義的認知及想像，進而回饋並鞏固得來不易的自由民主憲政秩序。
至於依促轉條例第6條第3項之規定撤銷並公告之案件，本會並未進行後續之賠償，因為本條例第6條第2項僅有方向及原則性之規定，而無具體之要件、賠償標準、請求期限及救濟方式等規範，亦無明確授權本會訂定法規命令，所以不宜由本會直接對個案當事人予以賠償。惟此不足之處，本會已經著手進行相關法制之研擬與規劃。